RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544550.5

SNHG1-220, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-220	ENST00000544550	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CCDC51	Q96ER9	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ANO3	Q9BYT9	981 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CHAD	O15335	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ATE1	O95260	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LRG1	P02750	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CAPNS1	P04632	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SLFN14	P0C7P3	912 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CALM1	P0DP23	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CALM2	P0DP24	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CALM3	P0DP25	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SDS	P20132	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FCAR	P24071	287 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ELF1	P32519	619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SREBF1	P36956	1147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DPP6	P42658	865 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF165	P49910	485 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SCNN1G	P51170	649 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	JAK3	P52333	1124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PDE1A	P54750	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CLC	Q05315	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SCAP	Q12770	1279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RAB33A	Q14088	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PTPA	Q15257	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PLK5	Q496M5	336 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550		Q6ZS52	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	HDX	Q7Z353	690 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	GAD1	Q99259	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNHG1-220	ENST00000544550	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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