RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SMAP	O00193	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WNT10B	O00744	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF195	O14628	629 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GSC2	O15499	205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ATP2C2	O75185	946 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RFPL1	O75677	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CBX6	O95503	412 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PFKM	P08237	780 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CD48	P09326	243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADRA1D	P25100	572 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NAMPT	P43490	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BPIFB4	P59827	614 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IL9R	Q01113	521 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FGD4	Q96M96	766 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SCN1A	P35498	2009 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SPAG7	O75391	227 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GABBR2	O75899	941 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EGFR	P00533	1210 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ASNS	P08243	561 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CYP3A5	P20815	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GNA15	P30679	374 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TFDP1	Q14186	410 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GBF1	Q92538	1859 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EVPL	Q92817	2033 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SOCS7	O14512	581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STAM2	O75886	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DCTN3	O75935	186 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FES	P07332	822 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KDELR1	P24390	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	STX2	P32856	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PSMC4	P43686	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NUMB	P49757	651 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PRKCE	Q02156	737 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CAPS	Q13938	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMED2	Q15363	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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