RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RLN3	Q8WXF3	142 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	NUP205	Q92621	2012 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	BICD1	Q96G01	975 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAB34	Q9BZG1	259 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM206	Q9H813	350 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAMTS20	P59510	1910 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYMK	A6NI61	221 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	LACTBL1	A8MY62	500 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691		H0YCG3	227 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691		K7EQS6	105 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	AP5Z1	O43299	807 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CTDNEP1	O95476	244 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYP	P08247	313 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SERPINF2	P08697	491 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	GUCY2F	P51841	1108 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC14A1	Q13336	389 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF174	Q15697	407 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ECM1	Q16610	540 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	EML3	Q32P44	896 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPATA1	Q5VX52	437 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD302	Q8IX05	232 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	DAW1	Q8N136	415 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PGBD3	Q8N328	593 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	FNBP1	Q96RU3	617 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	THADA	Q6YHU6	1953 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	APC2	O95996	2303 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CIT	O14578	2027 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYB561D2	O14569	222 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	DTNB	O60941	627 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ITPKA	P23677	461 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDE6C	P51160	858 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDR1	P51861	262 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM193A	P78312	1265 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSPY1	Q01534	308 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDIA5	Q14554	519 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF77	Q15935	545 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	FSIP1	Q8NA03	581 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RIN3	Q8TB24	985 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIR	O00625	290 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGAP33	O14559	1287 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PPEF2	O14830	753 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLS3	P13797	630 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP4	Q13107	963 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	KCNB1	Q14721	858 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SKAP1	Q86WV1	359 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALLC	Q8N6M5	410 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	HMGB4	Q8WW32	186 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.04	□□□□□ -0.48

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