RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC3Q9BY71 257 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 THAP9Q9H5L6 903 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MICAL2O94851 1124 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MYL4P12829 197 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CCR2P41597 374 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR15P49685 360 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP27A1Q02318 531 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 VSTM1Q6UX27 236 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GIPC2Q8TF65 315 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ING5Q8WYH8 240 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TCEAL4Q96EI5 215 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 DCXO43602 365 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CILPO75339 1184 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CEBPBP17676 345 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 BDNFP23560 247 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CETN1Q12798 172 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 STX1AQ16623 288 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ACOT1Q86TX2 421 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TATDN2Q93075 761 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ANO10Q9NW15 660 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MOSPD3O75425 235 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ASGR2P07307 311 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CSH1P0DML2 217 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CSH2P0DML3 217 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ALADP13716 330 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CD58P19256 250 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPN21Q16825 1174 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 DDR2Q16832 855 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC39CQ8N584 583 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR152Q8TDT2 470 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TWNKQ96RR1 684 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ARID3AQ99856 593 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GDE1Q9NZC3 331 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MUC3AQ02505 3323 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TECTAO75443 2155 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 FGF19O95750 216 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 PTMSP20962 102 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ORC1Q13415 861 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CUL2Q13617 745 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TAF12Q16514 161 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 STKLD1Q8NE28 680 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 LMO3Q8TAP4 145 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 WHAMMQ8TF30 809 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NT5C1BQ96P26 610 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP8B3O60423 1300 aa20.23■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1W2PRU2 124 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ANHXE9PGG2 379 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CLDN5O00501 218 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM66O15016 1216 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NOL4O94818 638 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GJA1P17302 382 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GABRR2P28476 465 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIK1P39086 918 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 LRMPQ12912 555 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 HTR4Q13639 388 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 POTEHQ6S545 545 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 GAREM2Q75VX8 874 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM35AQ86V20 835 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NXPE3Q969Y0 559 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA17Q96L03 361 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNK12Q9HB15 430 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 IL21Q9HBE4 155 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CISHQ9NSE2 258 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.22■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.21■□□□□ 0.83
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