RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518681.5

MIB2-231, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene MIB2, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-231	ENST00000518681	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TTLL6	Q8N841	843 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	STAM2	O75886	525 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	LMNB2	Q03252	620 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CAPS	Q13938	189 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	MORF4L2	Q15014	288 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	XKR3	Q5GH77	459 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	HEY2	Q9UBP5	337 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ABHD2	P08910	425 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PCK1	P35558	622 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ZBTB16	Q05516	673 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TRPC3	Q13507	836 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	GPRASP2	Q96D09	838 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CFAP36	Q96G28	342 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TEPSIN	Q96N21	525 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	MIPEP	Q99797	713 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		19.82	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681		A0A0B4J269	797 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	FAM83A	Q86UY5	434 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	MECR	Q9BV79	373 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	DPEP1	P16444	411 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	BGN	P21810	368 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TGFB2	P61812	414 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ACVR2B	Q13705	512 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	DLK2	Q6UY11	383 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TTC25	Q96NG3	672 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		19.81	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	19.8	■□□□□ 0.76	8e-8	■■■■□ 24.8
MIB2-231	ENST00000518681	LRCH4	O75427	683 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	OAT	P04181	439 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KIT	P10721	976 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KRT3	P12035	628 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	SERPINB3	P29508	390 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TMEM192	Q8IY95	271 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PORCN	Q9H237	461 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	GCK	P35557	465 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KCTD6	Q8NC69	237 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	SERAC1	Q96JX3	654 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	WRNIP1	Q96S55	665 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ENO4	A6NNW6	628 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ELK3	P41970	407 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CLDN10	P78369	228 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	IRX4	P78413	519 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		19.8	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	DCTN3	O75935	186 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ARL4C	P56559	192 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	FAAP100	Q0VG06	881 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ZNF699	Q32M78	642 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	FYB2	Q5VWT5	728 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CPXM1	Q96SM3	734 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	B4GALT5	O43286	388 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CALB1	P05937	261 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	PYGB	P11216	843 aa		19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
MIB2-231	ENST00000518681	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		19.79	■□□□□ 0.76

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