RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516252.1

RNU6-415P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 415, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-415P, Length 97 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-415P-201ENST00000516252 TMX2Q9Y320 296 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 A0A088AWK7 358 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 CGB1A6NKQ9 187 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 CELA2AP08217 269 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 JUPP14923 745 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 CYP2C18P33260 490 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 WNT3P56703 355 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 TREML2Q5T2D2 321 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 MAVSQ7Z434 540 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 CPA4Q9UI42 421 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 H0YIZ8 118 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 MARCH6O60337 910 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 NPSP0C0P6 89 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 CERS1P27544 350 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 MCL1Q07820 350 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 GTF2H3Q13889 308 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-415P-201ENST00000516252 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 HTR1BP28222 390 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 CLCN2P51788 898 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PDE1AP54750 535 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 EPHB1P54762 984 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 A0A1W2PPL8 197 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 UBXN7O94888 489 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 FESP07332 822 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 LIPAP38571 399 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC11A2P49281 568 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PDE6CP51160 858 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 UCP3P55916 312 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 GPSM2P81274 684 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 TFF2Q03403 129 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PCID2Q5JVF3 399 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 DDB2Q92466 427 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 GLG1Q92896 1179 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 A1L4Q6 167 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 AKAP10O43572 662 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 RFPL1O75677 317 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ENGP17813 658 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 TPTEP56180 551 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 KRT17Q04695 432 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 REPS1Q96D71 796 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 RNF7Q9UBF6 113 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 STAP2Q9UGK3 403 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 KAT6AQ92794 2004 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 RAB27AP51159 221 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF81P51508 661 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 TUBA4AP68366 448 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PROSER3Q2NL68 480 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-415P-201ENST00000516252 LRGUKQ96M69 825 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms