RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDCLQ13371 301 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAMLD1Q13495 774 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACAP1Q15027 740 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP2R5EQ16537 467 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HADHQ16836 314 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TIGD5Q53EQ6 642 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CLLU1OSQ5K130 101 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEL1L2Q5TEA6 688 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NT5DC3Q86UY8 548 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBA3Q8TBC4 463 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSFY1Q96LI6 401 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SYT15Q9BQS2 421 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM49BQ9NUQ9 324 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HMGXB4Q9UGU5 601 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H7C4K7 107 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SART1O43290 800 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PROSCO94903 275 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADORA2BP29275 332 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GABRB2P47870 512 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AMPD2Q01433 879 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLCB3Q01970 1234 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC26Q2I0M4 334 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR6B2Q6IFH4 312 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MFSD5Q6N075 450 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAAF5Q86Y56 855 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COLGALT2Q8IYK4 626 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C12orf29Q8N999 325 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC2A14Q8TDB8 520 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC01599Q8WXQ3 324 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HES6Q96HZ4 224 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CAPZA3Q96KX2 299 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRIM62Q9BVG3 475 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TLR10Q9BXR5 811 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DUSP16Q9BY84 665 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CARD9Q9H257 536 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC4Q9HBW1 653 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STK39Q9UEW8 545 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DYNC1I1O14576 645 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CEP104O60308 925 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COMTP21964 271 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LMO2P25791 158 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCNN1AP37088 669 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNA2P51530 1060 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RWDD2BP57060 319 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EFHC1Q5JVL4 640 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RHOT1Q8IXI2 618 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FNIP1Q8TF40 1166 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CASD1Q96PB1 797 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UBXN6Q9BZV1 441 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCB6Q9NP58 842 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AAASQ9NRG9 546 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASNSD1Q9NWL6 643 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADAM28Q9UKQ2 775 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COG5Q9UP83 839 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTC3P53804 2025 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OR6C75A6NL08 312 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSTPIP1O43586 416 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NCK2O43639 380 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DDHD2O94830 711 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FBXO21O94952 628 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UPP2O95045 317 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CFHP08603 1231 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NPR3P17342 541 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMA2P25787 234 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CTNNA2P26232 953 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITIH3Q06033 890 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE4CQ08493 712 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMARCB1Q12824 385 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTP4A2Q12974 167 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTPN20Q4JDL3 420 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF280DQ6N043 979 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM110Q86TL2 294 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms