RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SPC25Q9HBM1 224 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CASS4Q9NQ75 786 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TLK1Q9UKI8 766 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PCNTO95613 3336 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 ABCC6O95255 1503 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 GRM6O15303 877 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PROM1O43490 865 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SLC43A1O75387 559 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CACNA2D1P54289 1103 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TLR10Q9BXR5 811 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MATN4O95460 622 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 IGLV2-14P01704 120 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MMP10P09238 476 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SRGNP10124 158 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 DPEP1P16444 411 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CREMQ03060 361 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 VWA1Q6PCB0 445 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM5Q71RC9 77 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SSH3Q8TE77 659 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 RAB24Q969Q5 203 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 HDAC10Q969S8 669 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 COA7Q96BR5 231 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP26Q9BV47 211 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TDP1Q9NUW8 608 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MKS1Q9NXB0 559 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 JKAMPQ9P055 326 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CNTNAP1P78357 1384 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 BTAF1O14981 1849 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 KLHL33A6NCF5 533 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 GLTPD2A6NH11 291 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 GABRDO14764 452 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF10O60809 474 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 AGFG2O95081 481 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 FOLR3P41439 243 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TLE1Q04724 770 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 MTMR1Q13613 665 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 IL10RAQ13651 578 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 CLUL1Q15846 466 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 ATP2B3Q16720 1220 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TMX3Q96JJ7 454 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-217ENST00000509355 ITSN1Q15811 1721 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC154A6NI56 674 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 MT-CO1P00395 513 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CDK4P11802 303 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 KCNA2P16389 499 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 GATA3P23771 443 aa6.02□□□□□ -1.45
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PDE4D-217ENST00000509355 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 DMTF1Q9Y222 760 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SLIT3O75094 1523 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PIK3C2AO00443 1686 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SUN1O94901 812 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 C1RP00736 705 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 SLC16A1P53985 500 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 AMPD3Q01432 767 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 DSC2Q02487 901 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 DYRK1AQ13627 763 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-217ENST00000509355 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.456e-7■■■■■ 29.4
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF365Q70YC5 407 aa6.01□□□□□ -1.45
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