RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 MFSD5Q6N075 450 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 SZRD1Q7Z422 152 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ADSSL1Q8N142 457 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 MPP5Q8N3R9 675 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TEX9Q8N6V9 391 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 KCTD6Q8NC69 237 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CALML6Q8TD86 181 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 JMJD8Q96S16 334 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 AMNQ9BXJ7 453 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 USP44Q9H0E7 712 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CHODLQ9H9P2 273 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 DAPP1Q9UN19 280 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 SLC7A4O43246 635 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 MTSS1O43312 755 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 HMMRO75330 724 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TSPAN9O75954 239 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ECHS1P30084 290 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 NNMTP40261 264 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ANKRD1Q15327 319 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TMEM266Q2M3C6 531 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CCDC158Q5M9N0 1113 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 LCE1DQ5T752 114 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 FYB2Q5VWT5 728 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ABHD15Q6UXT9 468 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CEP97Q8IW35 865 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TTC39CQ8N584 583 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 USP6NLQ92738 828 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CUL5Q93034 780 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ACDQ96AP0 544 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CALML4Q96GE6 196 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 FEM1CQ96JP0 617 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 EYA3Q99504 573 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 SOX7Q9BT81 388 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 EDEM3Q9BZQ6 932 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ABCG4Q9H172 646 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 SEL1LQ9UBV2 794 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 DERAQ9Y315 318 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 MIA2Q96PC5 1412 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 ARHGEF5Q12774 1597 aa5.85□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 H3BS24 57 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CHL1O00533 1208 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 UBE2CO00762 179 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 MSTNO14793 375 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 RASSF9O75901 435 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 GLP2RO95838 553 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CKBP12277 381 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 LAMP2P13473 410 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 SCG2P13521 617 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 FAHP16930 419 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 FUT4P22083 530 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 PTGS1P23219 599 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 THBS2P35442 1172 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 PIK3CGP48736 1102 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 PER3P56645 1201 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 CORO7P57737 925 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.84□□□□□ -1.47
VNN3-211ENST00000509351 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms