RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPSEQ9Y251 543 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL4A2P08572 1712 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC38A8A6NNN8 435 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARNTLO00327 626 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCNE1P24864 410 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AVPR1AP37288 418 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF516Q92618 1163 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 DENND4CQ5VZ89 1909 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS13AQ96RL7 3174 aa24.95■■□□□ 1.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL1P05976 194 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFA8P51970 172 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNNC1P63316 161 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PATJQ8NI35 1801 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOL4O94818 638 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLSTN1O94985 981 aa24.94■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGEA11P43364 429 aa24.94■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL6P60660 151 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP27A1Q02318 531 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BIRC3Q13489 604 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXNDC8Q6A555 127 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADSSL1Q8N142 457 aa24.94■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.93■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 BDNFP23560 247 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATICP31939 592 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRIK1P39086 918 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP3M2P53677 418 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO15AQ9UKN7 3530 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OBSL1O75147 1896 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM186AA6NE01 2351 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOBPA7XYQ1 873 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NR3C1P04150 777 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR29P0C7W0 189 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANXA13P27216 316 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNK2Q07912 1038 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VSTM1Q6UX27 236 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRDQ9H2X0 955 aa24.91■■□□□ 1.58
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