RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 F8W810 466 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 LRRN2O75325 713 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 KRT37O76014 449 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 EFEMP2O95967 443 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 HLA-DRAP01903 254 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 CXCL8P10145 99 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 FERP16591 822 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 DSG1Q02413 1049 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 IQCEQ6IPM2 695 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 PALB2Q86YC2 1186 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TAF4BQ92750 862 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 DEF6Q9H4E7 631 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 NUMBLQ9Y6R0 609 aa15.04■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TGM5O43548 720 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 CCDC175P0C221 793 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 ANXA13P27216 316 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SOX5P35711 763 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 JAM2P57087 298 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 STARD6P59095 220 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 KRT83P78385 493 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 GCNT1Q02742 428 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 NCOA4Q13772 614 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM132DQ14C87 1099 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SPA17Q15506 151 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 WDR59Q6PJI9 974 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 VPS36Q86VN1 386 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 CEP120Q8N960 986 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SEMA4DQ92854 862 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 B3GALT6Q96L58 329 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 F8VZ95 297 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 ITGA4P13612 1032 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 GPC5P78333 572 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 DSC1Q08554 894 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SHDQ96IW2 340 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 GAD1Q99259 594 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 CHP1Q99653 195 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 RNF39Q9H2S5 420 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 CHST7Q9NS84 486 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 MIOSQ9NXC5 875 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 SNTG2Q9NY99 539 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 IPPQ9Y573 584 aa15.02■□□□□ -0
POLR1A-210ENST00000496892 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.02□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 COL4A3Q01955 1670 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 ARL5CA6NH57 179 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 AKR1B10O60218 316 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 GFPT2O94808 682 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 NDUFA10O95299 355 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 C1RP00736 705 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 TUBB4AP04350 444 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 ATICP31939 592 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 MLH1P40692 756 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 PRKCIP41743 596 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 SCNN1GP51170 649 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 WNT7BP56706 349 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 APBA1Q02410 837 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 LILRA6Q6PI73 481 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 BEST2Q8NFU1 509 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 FGF14Q92915 247 aa15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
POLR1A-210ENST00000496892 NCDNQ9UBB6 729 aa15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms