RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 NOL4O94818 638 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT19P08727 400 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP2F1P24903 491 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 PCSK1P29120 753 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM196Q5HYL7 178 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 TXNDC8Q6A555 127 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 PANK2Q9BZ23 570 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.21■■□□□ 1.47
TRDMT1-211ENST00000495022 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 GABRDO14764 452 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 AMPD2Q01433 879 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 DDR2Q16832 855 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 OSTM1Q86WC4 334 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 STKLD1Q8NE28 680 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TNMDQ9H2S6 317 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 EBF3Q9H4W6 596 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.2■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TADA3O75528 432 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO1EQ12965 1108 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SURF1Q15526 300 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 DPH6Q7L8W6 267 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM84AQ96KN4 292 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 INTS13Q9NVM9 706 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMA1P25391 3075 aa24.19■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PDGFRLQ15198 375 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FSTL4Q6MZW2 842 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PDILTQ8N807 584 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CHFRQ96EP1 664 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CHD8Q9HCK8 2581 aa24.18■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF233A6NK53 670 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ATG13O75143 517 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 MAGEA11P43364 429 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM171BQ6P995 826 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 RIN3Q8TB24 985 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 NETO1Q8TDF5 533 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CUEDC2Q9H467 287 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SEMA4GQ9NTN9 838 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 STX6O43752 255 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TNNC2P02585 160 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ARSAP15289 507 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 STK38Q15208 465 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CSRP2Q16527 193 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP68Q76N32 757 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 EXOC4Q96A65 974 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 HPDLQ96IR7 371 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRJQ12913 1337 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 USP17L7P0C7H9 530 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 DRD1P21728 446 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 MTF1Q14872 753 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF77Q15935 545 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 E2F4Q16254 413 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC142Q17RM4 750 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CPA6Q8N4T0 437 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 FSIP1Q8NA03 581 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM9Q9C026 710 aa24.16■■□□□ 1.46
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