RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEH1Q9H213 219 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 XDHP47989 1333 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WZ62 844 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 ACKR2O00590 384 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRC-212ENST00000491302 COQ9O75208 318 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 EGR1P18146 543 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 POLE2P56282 527 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 HSD11B2P80365 405 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 CRHR2Q13324 411 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZRM9 215 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 GDF7Q7Z4P5 450 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 PAF1Q8N7H5 531 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 GCC1Q96CN9 775 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 TEPSINQ96N21 525 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 NELL2Q99435 816 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 PTDSS2Q9BVG9 487 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRC-212ENST00000491302 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PIP5K1BO14986 540 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 RRP9O43818 475 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PIAS2O75928 621 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 SUN1O94901 812 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 DGKEP52429 567 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA8P53708 1063 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ALFQ53S48 1182 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 FAXCQ5TGI0 409 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZSN1 163 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 Q8TCH9 128 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 EDAQ92838 391 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHAC1Q9H158 963 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 CA14Q9ULX7 337 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PS29 197 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF185O15231 689 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF10O60809 474 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KA4O75676 772 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 RASAL1O95294 804 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA5P08648 1049 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 SCNN1GP51170 649 aa9.01□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 E2F2Q14209 437 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 SPARTQ8N0X7 666 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 EID2BQ96D98 161 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.01□□□□□ -0.97
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PTPRC-212ENST00000491302 AQP12BA6NM10 295 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 RGS10O43665 173 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 PPFIA4O75335 1185 aa9□□□□□ -0.97
PTPRC-212ENST00000491302 GLP2RO95838 553 aa9□□□□□ -0.97
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