RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 TAP1Q03518 808 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 CREG2Q8IUH2 290 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 ANKRD52Q8NB46 1076 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 LRRN4CLQ8ND94 238 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 SPOPO43791 374 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 ATP2C2O75185 946 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 ITGB1P05556 798 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 PCSK1P29120 753 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 GABRB2P47870 512 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 BCAT1P54687 386 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC181Q5TID7 509 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 SLC2A14Q8TDB8 520 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM7Q9C029 511 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXB3-210ENST00000489475 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CTAGE15A4D2H0 777 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TIMP1P01033 207 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 ERBB2P04626 1255 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CTAGE8P0CG41 777 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 DCUN1D2Q6PH85 259 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CTAGE6Q86UF2 777 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CTAGE4Q8IX94 777 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PBKQ96KB5 322 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SYT15Q9BQS2 421 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CES2O00748 559 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 GATMP50440 423 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 GSCP56915 257 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SNX16P57768 344 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 XYLT1Q86Y38 959 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SELENOOQ9BVL4 669 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 RNF14Q9UBS8 474 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CDH9Q9ULB4 789 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 EFCAB8A8MWE9 144 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 F8W810 466 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA8SH3BPF8 625 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0355O15063 1070 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PDE4CQ08493 712 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 UBL4BQ8N7F7 174 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 STK32AQ8WU08 396 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MCEEQ96PE7 176 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 LCMT1Q9UIC8 334 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM191CA6NGB0 347 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TADA3O75528 432 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 GJB6O95452 261 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 RAG1P15918 1043 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SLC1A1P43005 524 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PAFAH1B1P43034 410 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MDH1BQ5I0G3 518 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 IP6K2Q9UHH9 426 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHB8Q9UN66 801 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TBKBP1A7MCY6 615 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TRAPPC3O43617 180 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PROSCO94903 275 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TYMPP19971 482 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SLC8A3P57103 927 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PMF1Q6P1K2 205 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SIGLEC16A6NMB1 481 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 E5RJQ4 531 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CAPN15O75808 1086 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 KRT3P12035 628 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 RGS7P49802 495 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 OVOS1Q6IE37 1185 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 FUKQ8N0W3 1084 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 THEM5Q8N1Q8 247 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 VWCEQ96DN2 955 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 ACBD6Q9BR61 282 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MED10Q9BTT4 135 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 SLC4A5Q9BY07 1137 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TULP2O00295 520 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TADA2AO75478 443 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 TKTP29401 623 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CD101Q93033 1021 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 MCRS1Q96EZ8 462 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC66A2RUB6 948 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXB3-210ENST00000489475 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms