RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CEP68Q76N32 757 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 LONP2Q86WA8 852 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 RDH13Q8NBN7 331 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCB6Q9NP58 842 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 INTS13Q9NVM9 706 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 DLL3Q9NYJ7 618 aa25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 F5P12259 2224 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 SDHBP21912 280 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CCINQ13939 588 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 MON1AQ86VX9 555 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CXorf38Q8TB03 319 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 MMS19Q96T76 1030 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 HPS4Q9NQG7 708 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 C2orf42Q9NWW7 574 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF292O60281 2723 aa25.49■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PTPRJQ12913 1337 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CKMP06732 381 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARSAP15289 507 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 ARHGAP8P85298 464 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM83CQ9BQN1 747 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 SYT15Q9BQS2 421 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM9Q9C026 710 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PARD6AQ9NPB6 346 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.48■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 FRYLO94915 3013 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 K7ESF4 209 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 HRO43593 1189 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATP2C2O75185 946 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PDGFRBP09619 1106 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 AMPD2Q01433 879 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 C4orf50Q6ZRC1 276 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 FSIP1Q8NA03 581 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 IQUBQ8NA54 791 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA18Q8TC71 538 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CUEDC2Q9H467 287 aa25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 DMXL1Q9Y485 3027 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PPP6R2O75170 966 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 NOL4O94818 638 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CLSTN1O94985 981 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 RETP07949 1114 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 USP17L7P0C7H9 530 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 TNNI1P19237 187 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 HOXC13P31276 330 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CNR2P34972 360 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYP2J2P51589 502 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYP27A1Q02318 531 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 FNBP1Q96RU3 617 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 PKMYT1Q99640 499 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 BACH2Q9BYV9 841 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.46■■□□□ 1.67
PRKRIP1-205ENST00000477886 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SOBPA7XYQ1 873 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 GABRDO14764 452 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CLIC2O15247 247 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CUTAO60888 179 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 TADA3O75528 432 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 LMO2P25791 158 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRIK1P39086 918 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 IFNAR2P48551 515 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 PXNP49023 591 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MTF1Q14872 753 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 E2F4Q16254 413 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM26FQ5R3K3 315 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 DPH6Q7L8W6 267 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR49Q8IV35 697 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 MYLPFQ96A32 169 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 CDH9Q9ULB4 789 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 BDNFP23560 247 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANXA13P27216 316 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.44■■□□□ 1.66
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms