RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 HOOK3Q86VS8 718 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 C18orf8Q96DM3 657 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 TWNKQ96RR1 684 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 RNF39Q9H2S5 420 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-204ENST00000476231 VDRP11473 427 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CYP3A5P20815 502 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PMS2P54278 862 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 MAMLD1Q13495 774 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF6Q15052 776 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 AADACL2Q6P093 401 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 KLK14Q9P0G3 267 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 GPR182O15218 404 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CTSHP09668 335 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 RARAP10276 462 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 VEGFBP49765 207 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ATP1A2P50993 1020 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SLMAPQ14BN4 828 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TTC27Q6P3X3 843 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ERICH1Q86X53 443 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 GGA2Q9UJY4 613 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SNX24Q9Y343 169 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PIRO00625 290 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PPEF2O14830 753 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PNPLA4P41247 253 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CCT5P48643 541 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 NDST1P52848 882 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ITGA7Q13683 1181 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 HACE1Q8IYU2 909 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ART4Q93070 314 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ZNF560Q96MR9 790 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PROSCO94903 275 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 THPOP40225 353 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ACLYP53396 1101 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PLTPP55058 493 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PPP2R2AP63151 447 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PTK7Q13308 1070 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CNGA2Q16280 664 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SGO2Q562F6 1265 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 OR2W6PQ8NHA6 318 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TLCD1Q96CP7 247 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PRMT2P55345 433 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TAP1Q03518 808 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ORC1Q13415 861 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 PGM2Q96G03 612 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TRIM7Q9C029 511 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 NDUFAB1O14561 156 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 FKTNO75072 461 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 ECEL1O95672 775 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 CDR1P51861 262 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 STILQ15468 1287 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 KRT71Q3SY84 523 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 WHRNQ9P202 907 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 SCN1AP35498 2009 aa20.11■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 O00370 1275 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 MICAL2O94851 1124 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 RARGP13631 454 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 MAGEA9P43362 315 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 GUCY1A3Q02108 690 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 DENND2CQ68D51 928 aa20.1■□□□□ 0.81
SYF2-204ENST00000476231 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms