RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 USP18Q9UMW8 372 aa21.19■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CCL26Q9Y258 94 aa21.19■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.19■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 PTPRJQ12913 1337 aa21.19■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 GABRDO14764 452 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CUTAO60888 179 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 NOL4O94818 638 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 LPAL2Q16609 132 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC142Q17RM4 750 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MON1AQ86VX9 555 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 WDR49Q8IV35 697 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 IQUBQ8NA54 791 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 HPDLQ96IR7 371 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.18■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 HCRTO43612 131 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 TADA3O75528 432 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FNTBP49356 437 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 LMNB2Q03252 620 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 RUNX3Q13761 415 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 DPH6Q7L8W6 267 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 LONP2Q86WA8 852 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SYT15Q9BQS2 421 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 EBF3Q9H4W6 596 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 HPS4Q9NQG7 708 aa21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 UBE4BO95155 1302 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 K7ESF4 209 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SDHBP21912 280 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 DMWDQ09019 674 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SHC4Q6S5L8 630 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MYRFLQ96LU7 910 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CDH9Q9ULB4 789 aa21.16■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CKMP06732 381 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CNR2P34972 360 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 HOXD13P35453 343 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MAGEA11P43364 429 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 AMPD2Q01433 879 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.983e-8■■■■□ 25.4
COL9A3-210ENST00000472880 PDGFRLQ15198 375 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FSIP1Q8NA03 581 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 TTC16Q8NEE8 873 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MYLPFQ96A32 169 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 FNBP1Q96RU3 617 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MMS19Q96T76 1030 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 CACNA1AO00555 2505 aa21.14■□□□□ 0.98
COL9A3-210ENST00000472880 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 ATP2C2O75185 946 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 USP17L7P0C7H9 530 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 ARSAP15289 507 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 TNNI1P19237 187 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 CYP2J2P51589 502 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 ARHGAP8P85298 464 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 MTF1Q14872 753 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 FAM171BQ6P995 826 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 UNC13DQ70J99 1090 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 RDH13Q8NBN7 331 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 RIN3Q8TB24 985 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 C7orf25Q9BPX7 421 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.14■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
COL9A3-210ENST00000472880 RETP07949 1114 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms