RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465244.1

RBBP7-208, Transcript of RB binding protein 7, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 2

Gene RBBP7, Length 4,031 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7-208ENST00000465244 ENTPD1P49961 510 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 NCKAP1LP55160 1127 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 GJA9P57773 515 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 HERVK_113P62684 666 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TRAF2Q12933 501 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF174Q15697 407 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 C12orf60Q5U649 245 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 RESP18Q5W5W9 173 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CCDC89Q8N998 374 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 USP38Q8NB14 1042 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SERPINI1Q99574 410 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 INTS13Q9NVM9 706 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 FUOMA2VDF0 154 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 GPAA1O43292 621 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MTSS1O43312 755 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 UQCRBP14927 111 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ABCB4P21439 1286 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ANXA13P27216 316 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CASP1P29466 404 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 USP11P51784 963 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SHC4Q6S5L8 630 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ESR2Q92731 530 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 PMEPA1Q969W9 287 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 C12orf42Q96LP6 360 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MAGEB18Q96M61 343 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MTMR9Q96QG7 549 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TMEM206Q9H813 350 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 VPS4AQ9UN37 437 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 IPPQ9Y573 584 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SMCO2A6NFE2 343 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 EXOC3O60645 756 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 FAM228BP0C875 321 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 NR4A1P22736 598 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TNFRSF8P28908 595 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SERPINB10P48595 397 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 NEK3P51956 506 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CCNG1P51959 295 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ERVK-9P63128 1117 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 RNF43Q68DV7 783 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 OSBP2Q969R2 916 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 GBA3Q9H227 469 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SP140LQ9H930 580 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 PKD2L2Q9NZM6 624 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.05□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CENPXA8MT69 81 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TBX10O75333 385 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 PAEPP09466 180 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ALADP13716 330 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 VCLP18206 1134 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ARPP19P56211 112 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 COPZ1P61923 177 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TNFAIP1Q13829 316 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SEC23AQ15436 765 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MAPK6Q16659 721 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 APOA5Q6Q788 366 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ZNF384Q8TF68 577 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MTMR8Q96EF0 704 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 VPS35Q96QK1 796 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 NYAP2Q9P242 653 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 STK17AQ9UEE5 414 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 TRAF5O00463 557 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 ECE2O60344 883 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MYO1DO94832 1006 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 FAPQ12884 760 aa7.04□□□□□ -1.28
RBBP7-208ENST00000465244 MYLK3Q32MK0 819 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms