RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 CENPOQ9BU64 300 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 MKS1Q9NXB0 559 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 A6NCN8 305 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 TPP1O14773 563 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 GRM6O15303 877 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 SYNJ1O43426 1573 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 AP1G1O43747 822 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 CHKAP35790 457 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC16A1P53985 500 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ACAP2Q15057 778 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ARMC3Q5W041 872 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 HDAC10Q969S8 669 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 TLR10Q9BXR5 811 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.524e-6■■□□□ 14
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-204ENST00000461653 ABCC8Q09428 1581 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PEX1O43933 1283 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 AGFG2O95081 481 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV2-14P01704 120 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SBK3P0C264 359 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 HSPA6P17066 643 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 C5AR1P21730 350 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 CACNA2D1P54289 1103 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 LLGL1Q15334 1064 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 IFI44Q8TCB0 444 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SGCZQ96LD1 299 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 TAAR9Q96RI9 348 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 CDYLQ9Y232 598 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PS29 197 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA12O60330 932 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 NUCB1Q02818 461 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC138Q96M89 665 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.51□□□□□ -1.53
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RABGGTB-204ENST00000461653 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 J3KRW8 73 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SGTAO43765 313 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA5Q8NB90 893 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 APOL5Q9BWW9 433 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SMC4Q9NTJ3 1288 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PGAP2Q9UHJ9 254 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 SOGA1O94964 1423 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC151A5D8V7 595 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PRAMEF10O60809 474 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 MATN4O95460 622 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNA2P16389 499 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 FOLR3P41439 243 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 IL17REQ8NFR9 667 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM63Q969Q1 353 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-204ENST00000461653 TBATAQ96M53 351 aa5.5□□□□□ -1.53
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