RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 MED10Q9BTT4 135 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 DPYSL4O14531 572 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 BDNFP23560 247 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 GPR15P49685 360 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PPP3CAQ08209 521 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PAK1Q13153 545 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 WDR44Q5JSH3 913 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 GPR158Q5T848 1215 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FAM171BQ6P995 826 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 TMC8Q8IU68 726 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CEP63Q96MT8 703 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.86■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM66O15016 1216 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ECI2O75521 394 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 STX17P56962 302 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC142Q17RM4 750 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 VSTM1Q6UX27 236 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 SIX5Q8N196 739 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FBXL6Q8N531 539 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 SMARCD2Q92925 531 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ASIC4Q96FT7 647 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PCED1BQ96HM7 432 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PKMYT1Q99640 499 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CA14Q9ULX7 337 aa21.85■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 MAGEA11P43364 429 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 YAF2Q8IY57 180 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FLCNQ8NFG4 579 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ASB16Q96NS5 453 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC3Q9BY71 257 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 EHD2Q9NZN4 543 aa21.84■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CYP4F8P98187 520 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 PFKPQ01813 784 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 GAREM2Q75VX8 874 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 STKLD1Q8NE28 680 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 E2F7Q96AV8 911 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 WNT16Q9UBV4 365 aa21.83■■□□□ 1.09
SCAF8-204ENST00000461219 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 MOSPD3O75425 235 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CD58P19256 250 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 NDST1P52848 882 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 GPC5P78333 572 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CETN1Q12798 172 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ACOT1Q86TX2 421 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 BRD9Q9H8M2 597 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 RAB20Q9NX57 234 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.82■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 GNA14O95837 355 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 BMP6P22004 513 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 ASPAP45381 313 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 NLRP12P59046 1061 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 GRM2Q14416 872 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.81■■□□□ 1.08
SCAF8-204ENST00000461219 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms