RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460330.5

PTGER3-209, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 1,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-209ENST00000460330 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ATP1A3P13637 1013 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ATF6P18850 670 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 NTHL1P78549 312 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 APBA1Q02410 837 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF394Q53GI3 561 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 TTC39CQ8N584 583 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 UBR7Q8N806 425 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 C12orf29Q8N999 325 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.49■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 BECN2A8MW95 431 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 CLDN5O00501 218 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 CAVIN2O95810 425 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 BDNFP23560 247 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 GPR15P49685 360 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 EPHB3P54753 998 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 GCNT1Q02742 428 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 PLD1Q13393 1074 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 DDR2Q16832 855 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 LUZP1Q86V48 1076 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.48■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 PTPN2P17706 415 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 MAGEA11P43364 429 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 RAD23BP54727 409 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 KCNMA1Q12791 1236 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 GJB7Q6PEY0 223 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 ELMOD1Q8N336 334 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 GPR152Q8TDT2 470 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 GIPC2Q8TF65 315 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 CORO1BQ9BR76 489 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 SIX2Q9NPC8 291 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 CLUHO75153 1309 aa20.47■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 TPM2P07951 284 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 RHOP08100 348 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 CCDC130P13994 396 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 IQCEQ6IPM2 695 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 FUKQ8N0W3 1084 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.46■□□□□ 0.87
PTGER3-209ENST00000460330 GRIK1P39086 918 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 CACNA2D1P54289 1103 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 TMEM270Q6UE05 265 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 VSTM1Q6UX27 236 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 STKLD1Q8NE28 680 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 PSMG2Q969U7 264 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 MED10Q9BTT4 135 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 LRRC3Q9BY71 257 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 ASB3Q9Y575 518 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 ZP2Q05996 745 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 VEPH1Q14D04 833 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 FAM35AQ86V20 835 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 TSPY26PQ9H489 355 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 NOTCH4Q99466 2003 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 LGALS16A8MUM7 142 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 F8VP50 259 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 FSHRP23945 695 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 CCR2P41597 374 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 MFAP3P55082 362 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 MTMR3Q13615 1198 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 ITIH5Q86UX2 942 aa20.44■□□□□ 0.86
PTGER3-209ENST00000460330 ITFG1Q8TB96 612 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms