RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP46-201ENST00000441222 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 B2RBV5 119 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 PSMC6P62333 389 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 RDM1Q8NG50 284 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 RNF112Q9ULX5 631 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 H7C4K7 107 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 IPPQ9Y573 584 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 MGAT4DA6NG13 374 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 NFIAQ12857 509 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.93□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SRLQ86TD4 932 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 STK39Q9UEW8 545 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SLC25A27O95847 323 aa6.92□□□□□ -1.3
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