RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 CBX8Q9HC52 389 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 EHD2Q9NZN4 543 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 SUFUQ9UMX1 484 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ANK1P16157 1881 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0B4J269 797 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 MTMR11A4FU01 709 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 E9PMD0 336 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 PIRO00625 290 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 FAM163BP0C2L3 166 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 PLA2G4BP0C869 781 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 MYBP10242 640 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 DRD1P21728 446 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CTHP32929 405 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ARPP19P56211 112 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GTF2BQ00403 316 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GRM2Q14416 872 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TEAD2Q15562 447 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 SV2CQ496J9 727 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 IQUBQ8NA54 791 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GAB3Q8WWW8 586 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 BICD1Q96G01 975 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM5Q9C035 493 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM206Q9H813 350 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 PARVGQ9HBI0 331 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TBX20Q9UMR3 447 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 I3L4J1 428 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 K7ESF4 209 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 FAM189A1O60320 539 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF806P0C7X5 589 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 LILRA4P59901 499 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TYRO3Q06418 890 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CCINQ13939 588 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 DCLK2Q8N568 766 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ACDQ96AP0 544 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 OBSL1O75147 1896 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 A0A087WWV3 80 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 LACTBL1A8MY62 500 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 RHOBTB1O94844 696 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 FAM13AO94988 1023 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CSH1P0DML2 217 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CSH2P0DML3 217 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 GAP43P17677 238 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CCNE1P24864 410 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ME1P48163 572 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TAF6P49848 677 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 OSTNP61366 133 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ITFG2Q969R8 447 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 SENP8Q96LD8 212 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 EBF1Q9UH73 591 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 DTNBO60941 627 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 VNN2O95498 520 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CXCL8P10145 99 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 RAP1GAPP47736 663 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 PPP3CCP48454 512 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 LMAN1P49257 510 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CCZ1BP86790 482 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-204ENST00000440835 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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