RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 TSC2P49815 1807 aa20.13■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ARNTLO00327 626 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 F11P03951 625 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PFKFB1P16118 471 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ANXA13P27216 316 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ATICP31939 592 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MAGEA11P43364 429 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 NRLP54845 237 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 VSTM1Q6UX27 236 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 OSTM1Q86WC4 334 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PKMYT1Q99640 499 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CHRDQ9H2X0 955 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1B0GVL5 298 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 NOL4O94818 638 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PRAMEF12O95522 483 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SYKP43405 635 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PDE6CP51160 858 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CCR3P51677 355 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 AMPD2Q01433 879 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CYP27A1Q02318 531 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MTAPQ13126 283 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 BIRC3Q13489 604 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 FAM171BQ6P995 826 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MON1AQ86VX9 555 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 EXOC4Q96A65 974 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MYRFLQ96LU7 910 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TDP1Q9NUW8 608 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 NCANO14594 1321 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TACC1O75410 805 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PDGFRBP09619 1106 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 GRIK1P39086 918 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 GPR15P49685 360 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MYLPFQ96A32 169 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SCN1AP35498 2009 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SHISA7A6NL88 538 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TRIM66O15016 1216 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 USP17L7P0C7H9 530 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 LMO2P25791 158 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CTHP32929 405 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 STK4Q13043 487 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 FZD5Q13467 585 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TXNDC8Q6A555 127 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SPATA17Q96L03 361 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 PDXKO00764 312 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 KLRC4O43908 158 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ATP2C2O75185 946 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CKMP06732 381 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CHRNB1P11230 501 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 P4HA1P13674 534 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 BDNFP23560 247 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 CXCL12P48061 93 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 TTC8Q8TAM2 541 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 RUBCNQ92622 972 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 GKN1Q9NS71 199 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 HPSEQ9Y251 543 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC78-204ENST00000439619 USP34Q70CQ2 3546 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC78-204ENST00000439619 COL4A3Q01955 1670 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms