RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435576.2

TRABD2B-201, Transcript of TraB domain containing 2B, humanhuman

TSL 3

Gene TRABD2B, Length 619 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2B-201ENST00000435576 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 TWNKQ96RR1 684 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 ARID3AQ99856 593 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 ASAH2Q9NR71 780 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 DACH1Q9UI36 760 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 CDH7Q9ULB5 785 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 ASB3Q9Y575 518 aa14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRABD2B-201ENST00000435576 CLDN5O00501 218 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 DCXO43602 365 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC192P0DO97 292 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 MYL4P12829 197 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 BDNFP23560 247 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 MAGEA11P43364 429 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CACNA2D1P54289 1103 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 PTPN21Q16825 1174 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 GAREM2Q75VX8 874 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ACOT1Q86TX2 421 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 LMO3Q8TAP4 145 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 SHKBP1Q8TBC3 707 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 WHAMMQ8TF30 809 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 KCNK12Q9HB15 430 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 TRIOO75962 3097 aa14.64□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ANHXE9PGG2 379 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ZNF197O14709 1029 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CILPO75339 1184 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 MICAL2O94851 1124 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CD58P19256 250 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 MTMR3Q13615 1198 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 VEPH1Q14D04 833 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 WDR44Q5JSH3 913 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ITIH5Q86UX2 942 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 UNC93AQ86WB7 457 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 LEMD2Q8NC56 503 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 TNIP3Q96KP6 325 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 THAP9Q9H5L6 903 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 IL21Q9HBE4 155 aa14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 PATJQ8NI35 1801 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 A0A1W2PRU2 124 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 P4HA2O15460 535 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 LRMPQ12912 555 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 HTR4Q13639 388 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 TEAD2Q15562 447 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 PARM1Q6UWI2 310 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 VSTM1Q6UX27 236 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 C12orf29Q8N999 325 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 FGF14Q92915 247 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CISHQ9NSE2 258 aa14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 F8VP50 259 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 NOL4O94818 638 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CSH1P0DML2 217 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CSH2P0DML3 217 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ALADP13716 330 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC130P13994 396 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 GABRR2P28476 465 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 GRIK1P39086 918 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 ZXDAP98168 799 aa14.61□□□□□ -0.07
TRABD2B-201ENST00000435576 CUL2Q13617 745 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms