RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMG2Q969U7 264 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MARCH6O60337 910 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSAPP07602 524 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMARCA1P28370 1054 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDC25CP30307 473 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AVPR1AP37288 418 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFNAR2P48551 515 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIN1Q05586 938 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INF2Q27J81 1249 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAB4Q2WGN9 574 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EID2Q8N6I1 236 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BEST2Q8NFU1 509 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP89Q96ST8 783 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD248Q9HCU0 757 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTGESO14684 152 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYTH3O43739 400 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GAT3O94766 335 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LDLRP01130 860 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP55Q53EZ4 464 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR174Q9BXC1 333 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL21Q9HBE4 155 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SATB2Q9UPW6 733 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TACC2O95359 2948 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PQF6 199 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEIS1O00470 390 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSO75390 466 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGAVP06756 1048 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THP07101 528 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXB2P14652 356 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNFRSF4P43489 277 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLE2P56282 527 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKCEQ02156 737 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQCA1Q86XH1 822 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAP25Q8TEE9 199 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ESR2Q92731 530 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HPS3Q969F9 1004 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GCNAQ96QF7 691 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OBSL1O75147 1896 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 I3L4J1 428 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPAN1O60635 241 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTN2O75298 545 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KAT7O95251 611 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APODP05090 189 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NT5C2P49902 561 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MLLT10P55197 1068 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SV2AQ7L0J3 742 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CBX8Q9HC52 389 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYN3O14994 580 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOBOXO60393 691 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERLIN2O94905 339 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VNN2O95498 520 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NADKO95544 446 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRCC3P46736 316 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALDH1A3P47895 512 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP85Q6P2H3 762 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BORAQ6PGQ7 559 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITIH5Q86UX2 942 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNKPQ96T60 521 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASS4Q9NQ75 786 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms