RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.16□□□□□ -0.78
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HDLBP-211ENST00000425989 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
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HDLBP-211ENST00000425989 PCNTO95613 3336 aa10.13□□□□□ -0.79
HDLBP-211ENST00000425989 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 78.1
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM43BA6NCK2 446 aa10.13□□□□□ -0.79
HDLBP-211ENST00000425989 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.13□□□□□ -0.79
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