RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TNFRSF4P43489 277 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 INAVAQ3KP66 663 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TXNDC8Q6A555 127 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OXER1Q8TDS5 423 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NACC1Q96RE7 527 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PNKPQ96T60 521 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRIM4Q9C037 500 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RGL1Q9NZL6 768 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PTPRDP23468 1912 aa9.33□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADAM23O75077 832 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SOAT2O75908 522 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TDP2O95551 362 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 F11P03951 625 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP17L7P0C7H9 530 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNE1P15382 129 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GABRG2P18507 467 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GRIA2P42262 883 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NLRP12P59046 1061 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYO1EQ12965 1108 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TPH2Q8IWU9 490 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RIN3Q8TB24 985 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM206Q9H813 350 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 VAV3Q9UKW4 847 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NID2Q14112 1375 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.32□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MEI4A8MW99 385 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BRINP1O60477 761 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KAT7O95251 611 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CR2P20023 1033 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAOBP27338 520 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSPA4P34932 840 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GRM5P41594 1212 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 VAC14Q08AM6 782 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMARCB1Q12824 385 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NFATC3Q12968 1075 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF77Q15935 545 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EMC10Q5UCC4 262 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 XKR5Q6UX68 686 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERICH1Q86X53 443 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTC16Q8NEE8 873 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DYDC2Q96IM9 177 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CPNE5Q9HCH3 593 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.31□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ANTXRLA6NF34 631 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PCDHGA12O60330 932 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SLITRK3O94933 977 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LYPLA2O95372 231 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LARGE1O95461 756 aa9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LIG1P18858 919 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms