RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.16■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 ITIH5Q86UX2 942 aa22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 SEMA4DQ92854 862 aa22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 PKMYT1Q99640 499 aa22.16■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 NOTCH4Q99466 2003 aa22.15■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.15■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.15■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.15■■□□□ 1.14
C4orf48-201ENST00000409248 CEP72Q9P209 647 aa22.15■■□□□ 1.14
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C4orf48-201ENST00000409248 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.14■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.14■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.14■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.14■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 SOAT2O75908 522 aa22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 MICAL2O94851 1124 aa22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 FGF19O95750 216 aa22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 LAMP2P13473 410 aa22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 EPHA5P54756 1037 aa22.13■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 UBXN1Q04323 297 aa22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 MTMR3Q13615 1198 aa22.13■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 ITFG1Q8TB96 612 aa22.13■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 FGF13Q92913 245 aa22.13■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 MYLPFQ96A32 169 aa22.13■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.12■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.11■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.11■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 ATP8B3O60423 1300 aa22.1■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 MUC3AQ02505 3323 aa22.1■■□□□ 1.13
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C4orf48-201ENST00000409248 CEBPBP17676 345 aa22.1■■□□□ 1.13
C4orf48-201ENST00000409248 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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