RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 ATP2C2O75185 946 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 TIMP1P01033 207 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 COMTP21964 271 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 MNS1Q8NEH6 495 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 DSEQ9UL01 958 aa21.47■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 CES2O00748 559 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 DNA2P51530 1060 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 IKBKEQ14164 716 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 XYLT1Q86Y38 959 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 CD101Q93033 1021 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.46■■□□□ 1.03
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MYO1FO00160 1098 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TULP2O00295 520 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TADA3O75528 432 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 GJB6O95452 261 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 OR1G1P47890 313 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 BCAT1P54687 386 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PDE4CQ08493 712 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC142Q17RM4 750 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PMF1Q6P1K2 205 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 FUKQ8N0W3 1084 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 STK32AQ8WU08 396 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SYT15Q9BQS2 421 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CDH9Q9ULB4 789 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TYMPP19971 482 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ADORA2BP29275 332 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TAP1Q03518 808 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SYNCQ9H7C4 482 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.45■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 KCNK3O14649 394 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PCSK1P29120 753 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 METTL23Q86XA0 190 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PBKQ96KB5 322 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ACBD6Q9BR61 282 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ST7Q9NRC1 585 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 VWA8A3KMH1 1905 aa21.44■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 E5RJQ4 531 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CAPN15O75808 1086 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PROSCO94903 275 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SLC1A1P43005 524 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RPL34P49207 117 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM110Q86TL2 294 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MCEEQ96PE7 176 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MIS12Q9H081 205 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RNF14Q9UBS8 474 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 COL4A6Q14031 1691 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 NRP1O14786 923 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CSF2RAP15509 400 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 RGS7P49802 495 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 PLCB3Q01970 1234 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 HCSTQ9UBK5 93 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ALPK3Q96L96 1907 aa21.43■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 TBKBP1A7MCY6 615 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.42■■□□□ 1.02
HDDC3-202ENST00000394272 SPOPO43791 374 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms