RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GNA15P30679 374 aa31.4■■■□□ 2.62
ECHS1-201ENST00000368547 GPR17Q13304 367 aa31.4■■■□□ 2.62
ECHS1-201ENST00000368547 RAB33AQ14088 237 aa31.4■■■□□ 2.62
ECHS1-201ENST00000368547 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
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ECHS1-201ENST00000368547 PCED1BQ96HM7 432 aa31.4■■■□□ 2.62
ECHS1-201ENST00000368547 PGLYRP2Q96PD5 576 aa31.4■■■□□ 2.62
ECHS1-201ENST00000368547 AIPL1Q9NZN9 384 aa31.4■■■□□ 2.62
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ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
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ECHS1-201ENST00000368547 MED10Q9BTT4 135 aa31.36■■■□□ 2.61
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ECHS1-201ENST00000368547 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
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ECHS1-201ENST00000368547 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 SLC20A1Q8WUM9 679 aa31.34■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN16Q9UKR8 245 aa31.34■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa31.33■■■□□ 2.61
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ECHS1-201ENST00000368547 SERPING1P05155 500 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 BDNFP23560 247 aa31.33■■■□□ 2.61
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ECHS1-201ENST00000368547 KLHL30Q0D2K2 578 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRE1Q14246 886 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 CNGA2Q16280 664 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP221Q4G0U5 840 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 TAF3Q5VWG9 929 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 FAM35AQ86V20 835 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 SPPL2BQ8TCT7 592 aa31.33■■■□□ 2.61
ECHS1-201ENST00000368547 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
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