RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 C5orf34Q96MH7 638 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 HESX1Q9UBX0 185 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 NPSP0C0P6 89 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-202ENST00000368205 ENGP17813 658 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 CBSP35520 551 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 NOGQ13253 232 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-202ENST00000368205 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 TTC3P53804 2025 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 E5RJQ4 531 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 DCLK1O15075 740 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP25P42331 645 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 MTMR1Q13613 665 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 GPR162Q16538 588 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRK-202ENST00000368205 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 CPA6Q8N4T0 437 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 RITA1Q96K30 269 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ABCF2Q9UG63 623 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 WDR17Q8IZU2 1322 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-202ENST00000368205 SP2Q02086 613 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 RABEP1Q15276 862 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 LONRF3Q496Y0 759 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 CNGA4Q8IV77 575 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-202ENST00000368205 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 FAM167AQ96KS9 214 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 GLOD4Q9HC38 313 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-202ENST00000368205 SOCS2O14508 198 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 ERC2O15083 957 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 PDE1AP54750 535 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 ODF1Q14990 250 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 EMC10Q5UCC4 262 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 LAYNQ6UX15 382 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZWC4 215 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRK-202ENST00000368205 PRR18Q8N4B5 295 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRK-202ENST00000368205 GABRQQ9UN88 632 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 A1L4Q6 167 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 DTNBO60941 627 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRK-202ENST00000368205 SNHG28P0DPA3 235 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 TYRP14679 529 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 ITKQ08881 620 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 IQCB1Q15051 598 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 TWIST1Q15672 202 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 Q4G0T1 1027 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.01□□□□□ -1.61
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