RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 B3GAT3O94766 335 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DDHD2O94830 711 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 EOMESO95936 686 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ITGB1P05556 798 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TCF4P15884 667 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GABRB2P47870 512 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SLC7A5Q01650 507 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PDE4CQ08493 712 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 FAAP100Q0VG06 881 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 C3orf20Q8ND61 904 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 E5RJQ4 531 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN5O00501 218 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GABRDO14764 452 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 KRT3P12035 628 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CTNNA2P26232 953 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 C1QTNF8P60827 252 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TLE2Q04725 743 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ITIH3Q06033 890 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GRIK3Q13003 919 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 EMC1Q8N766 993 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SLC2A14Q8TDB8 520 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 KRT12Q99456 494 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CARD9Q9H257 536 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC66A2RUB6 948 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CYP2C18P33260 490 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CLCN6P51797 869 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TUSC3Q13454 348 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 STILQ15468 1287 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM60Q495X7 471 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF333Q96JL9 665 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.21■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GRAP2O75791 330 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 SLC1A1P43005 524 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 GATMP50440 423 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 RABGGTBP53611 331 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 VSNL1P62760 191 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 TUBB4BP68371 445 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 TAF5Q15542 800 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 HESX1Q9UBX0 185 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 KRIT1O00522 736 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 PITPNM1O00562 1244 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 BEST1O76090 585 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 GJC1P36383 396 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 RWDD2BP57060 319 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 FUKQ8N0W3 1084 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 HIPK3Q9H422 1215 aa16.2■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 TTC3P53804 2025 aa16.19■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.19■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 INPPL1O15357 1258 aa16.19■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.19■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.19■□□□□ 0.18
CASQ1-201ENST00000368078 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms