RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CNGA2Q16280 664 aa29.48■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 SPPL2BQ8TCT7 592 aa29.48■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 SLC2A14Q8TDB8 520 aa29.48■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 LRCH3Q96II8 777 aa29.48■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 HGSNATQ68CP4 663 aa29.46■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 PALB2Q86YC2 1186 aa29.45■■■□□ 2.31
GIPC1-201ENST00000345425 SMARCD1Q96GM5 515 aa29.45■■■□□ 2.31
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GIPC1-201ENST00000345425 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.44■■■□□ 2.3
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GIPC1-201ENST00000345425 SYT11Q9BT88 431 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-201ENST00000345425 LHX5Q9H2C1 402 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-201ENST00000345425 MYO7AQ13402 2215 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-201ENST00000345425 VNN2O95498 520 aa29.41■■■□□ 2.3
GIPC1-201ENST00000345425 NPR3P17342 541 aa29.41■■■□□ 2.3
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