RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 MTA2O94776 668 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ATG7O95352 703 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 IVDP26440 423 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TAS2R40P59535 323 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TCEAL1Q15170 157 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 WDR78Q5VTH9 848 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CCNJLQ8IV13 435 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 INPP5DQ92835 1189 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CDHR1Q96JP9 859 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TCHPQ9BT92 498 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 GAS8O95995 478 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 USH1CQ9Y6N9 552 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PSMC4P43686 418 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 STAT5BP51692 787 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ORC1Q13415 861 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 WDR44Q5JSH3 913 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 B4GALT5O43286 388 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 IL9RQ01113 521 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 USP4Q13107 963 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CUL2Q13617 745 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 MGAMO43451 1857 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 A0A0B4J269 797 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 CDH16O75309 829 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM192Q8IY95 271 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 NRG4Q8WWG1 115 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 EVPLQ92817 2033 aa20.4■□□□□ 0.86
ZNF554-201ENST00000317243 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GNA15P30679 374 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GTF2H1P32780 548 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 VHLP40337 213 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NAMPTP43490 491 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CACNA2D1P54289 1103 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RTP1P59025 263 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 STOML1Q9UBI4 398 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 WEE2P0C1S8 567 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 CLDN10P78369 228 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PTK6Q13882 451 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RCN1Q15293 331 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF365Q70YC5 407 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MON1BQ7L1V2 547 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 FAM210AQ96ND0 272 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.39■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RALAP11233 206 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MYL6P60660 151 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NCOA4Q13772 614 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 RNF149Q8NC42 400 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DCLK3Q9C098 648 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 SERPINB4P48594 390 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MOGSQ13724 837 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ICAM3P32942 547 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 NOMO3P69849 1222 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 ATL2Q8NHH9 583 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO41Q8TF61 875 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.37■□□□□ 0.85
ZNF554-201ENST00000317243 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms