RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.56■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 B4GALT5O43286 388 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 KDELR1P24390 212 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 XYLT1Q86Y38 959 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 OTUD5Q96G74 571 aa20.56■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 ELP3Q9H9T3 547 aa20.56■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 GABRB2P47870 512 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 MYO1EQ12965 1108 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM63BQ5T3F8 832 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 HAUS1Q96CS2 278 aa20.55■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 MIS12Q9H081 205 aa20.55■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.55■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 CPXM1Q96SM3 734 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 C22orf31O95567 290 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 GCAP28676 217 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 KCTD6Q8NC69 237 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 PCK1P35558 622 aa20.53■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 CCDC125Q86Z20 511 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC63Q8NA47 563 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 TRABDQ9H4I3 376 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.53■□□□□ 0.88
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SPNS1-201ENST00000311008 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 OTOFQ9HC10 1997 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 MICAL2O94851 1124 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 APOC2P02655 101 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS1-201ENST00000311008 ERBB2P04626 1255 aa20.53■□□□□ 0.88
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