RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304032.12

AGAP1-201, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene AGAP1, Length 10,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1-201ENST00000304032 CDHR1Q96JP9 859 aa14.67□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 ATP9BO43861 1147 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 BMP3P12645 472 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 CCDC17Q96LX7 622 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L15C9J2P7 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L11C9JVI0 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L18D6R9N7 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L22D6RA61 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L19D6RCP7 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L20D6RJB6 530 aa14.67□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 USP17L24Q0WX57 530 aa14.67□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 AP3B2Q13367 1082 aa14.67□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 TRIM73Q86UV7 250 aa14.67□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 HMG20AQ9NP66 347 aa14.67□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 RRN3Q9NYV6 651 aa14.66□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
AGAP1-201ENST00000304032 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.66□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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AGAP1-201ENST00000304032 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.65□□□□□ -0.06
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