RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc170D3YXL0 722 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp457L7N1X4 647 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AfmO89020 608 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Uchl4P58321 233 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ugt1a2P70691 533 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdk16Q04735 496 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tfdp1Q08639 410 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Syn2Q64332 586 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdc14aQ6GQT0 603 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CenpuQ8C4M7 410 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdha2Q91Y17 948 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lpgat1Q91YX5 370 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf704Q9ERQ3 566 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdzd4Q9QY39 772 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc26a3Q9WVC8 757 aa21.7■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt19P19001 403 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scp2P32020 547 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbc1d10aP58802 500 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CiitaP79621 1155 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Upf3bQ3ULL6 472 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rcsd1Q3UZA1 412 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dzip1lQ499E4 774 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem45aQ60774 273 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LbpQ61805 481 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 ClasrpQ8CFC7 668 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pgm1Q9D0F9 562 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clec4aQ9QZ15 238 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdh9F8VPK8 1237 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmigd3G3X8R9 209 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Myl4P09541 193 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Marcksl1P28667 200 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DmpkP54265 631 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkcbP68404 671 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FerP70451 823 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RilpQ5ND29 369 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pkn2Q8BWW9 983 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Castor1Q9CWQ8 331 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fundc1Q9DB70 155 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf14Q9JI90 485 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prmt2Q9R144 448 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tll2Q9WVM6 1012 aa21.69■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Speer2E9Q9U2 264 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Icam1P13597 537 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PdgfaP20033 211 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PrkchP23298 683 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 TxkP42682 527 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Igfbp4P47879 254 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam189a2Q4FZH1 290 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm14685Q52KH6 695 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SowahcQ8C0J6 512 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zbtb44Q8R0A2 453 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gga1Q8R0H9 635 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snap47Q8R570 413 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vti1aO89116 217 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sem1P60897 70 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tor4aQ8BH02 426 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cpa5Q8R4H4 436 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bag2Q91YN9 210 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf135Q9CWS1 417 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Iqcf1Q9D9K8 182 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Capn12Q9ER56 720 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc8a3S4R2P9 928 aa21.67■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wdr95D3Z7A8 784 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccr1P51675 355 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PhbP67778 272 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Muc1Q02496 630 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mark3Q03141 753 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grm2Q14BI2 872 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SpoplQ2M2N2 392 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc9b2Q5BKR2 547 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp943Q6NZP4 507 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Snx19Q6P4T1 997 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf507Q6ZPY5 941 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mapk15Q80Y86 549 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slitrk1Q810C1 696 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Leg1Q8C6C9 337 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1502Q8VG66 316 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdha10Q91Y20 946 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tas1r1Q99PG6 842 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf181Q9CY62 165 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tekt1Q9DAJ2 418 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hao1Q9WU19 370 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ggt5Q9Z2A9 573 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Clcn3P51791 818 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VegfaQ00731 214 aa21.66■■□□□ 1.06
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 VcpQ01853 806 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms