RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047207.6

Ccdc27-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc27, Length 2,089 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ifi207E9Q3L4 978 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gad2P48320 585 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cacnb3P54285 484 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Q3TQQ9 903 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Itga1Q3V3R4 1179 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Kctd8Q50H33 476 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gpr156Q6PCP7 798 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tdpoz2Q717B2 364 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Olfr299Q7TS05 330 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 March4Q80TE3 409 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 NfascQ810U3 1240 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Znf76Q8BMU0 568 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Trim14Q8BVW3 440 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 EtnpplQ8BWU8 499 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Atg16l1Q8C0J2 607 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gpc5Q8CAL5 572 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pdik1lQ8QZR7 341 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tekt2Q922G7 430 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dtwd1Q9D8U7 304 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tmco5aQ9D9D5 303 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Plscr2Q9DCW2 307 aa14.75□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm3460E9QAI8 215 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Bub1O08901 1058 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PtgisO35074 501 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Per1O35973 1291 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Slurp2P0DP59 97 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pde6bP23440 856 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tlr8P58682 1032 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Npas2P97460 816 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 4930430A15RikQ05AC5 485 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ag2Q3UPL5 249 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Clhc1Q5M6W3 596 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Elmo3Q8BYZ7 720 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 OafQ8QZR4 282 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Myoz3Q8R4E4 245 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cd300ldQ8VCH2 221 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Sorcs3Q8VI51 1219 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Psmd6Q99JI4 389 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Arhgef25Q9CWR0 618 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ccdc130Q9D516 385 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Copg2Q9QXK3 871 aa14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Abt1Q9QYL7 269 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 AspgA0JNU3 564 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tubb1A2AQ07 451 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ttll6A4Q9E8 822 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Slfn9B1ARD6 910 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Kpna7C0LLJ0 499 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm20721E9Q2U8 318 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gm3264L7N2C5 238 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tspyl1O88852 379 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Spdye4aQ5IBH6 268 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Gpd2Q64521 727 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pip4k2cQ91XU3 421 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Grk2Q99MK8 689 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 StambpQ9CQ26 424 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ccdc97Q9DBT3 340 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Slc26a3Q9WVC8 757 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Myh14Q6URW6 2000 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Fignl2J3QK54 644 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ebf3O08791 596 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ptk2P34152 1090 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Pex2P55098 305 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Psmc5P62196 406 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tbx3P70324 741 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 InhbaQ04998 424 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 SpoplQ2M2N2 392 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Q3U4G0 281 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ntrk1Q3UFB7 799 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Tbc1d22bQ80VE5 505 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Dusp4Q8BFV3 398 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Svs3bQ8BZH8 265 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Stoml1Q8CI66 399 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Batf3Q9D275 118 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 DpysQ9EQF5 519 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cables1Q9ESJ1 568 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 PolhQ9JJN0 694 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Capn7Q9R1S8 813 aa14.73□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Prdm12A2AJ77 365 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Galntl6E5D8G1 601 aa14.72□□□□□ -0.05
Ccdc27-201ENSMUST00000047207 Cyp4f40G3UW81 524 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.8 ms