RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035812.13

Ttl-201, Transcript of Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttl, Length 4,567 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttl-201ENSMUST00000035812 Dlgap1Q9D415 992 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 MefvQ9JJ26 767 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cep290Q6A078 2472 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rrm1P07742 792 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Znf532Q6NXK2 1036 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Klhl38Q8BSF5 581 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Plekhh3Q8VCE9 796 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Serpina3nQ91WP6 418 aa16.98■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tmem237Q3V0J1 427 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Oca2Q62052 833 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ttc24Q8BYG0 334 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tlcd1Q99JT6 247 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mmrn1B2RPV6 1210 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm3460E9QAI8 215 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ap3d1O54774 1199 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Drc1Q3USS3 753 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Trim80Q3V061 624 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Arhgap1Q5FWK3 439 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Slc30a5Q8R4H9 761 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sgip1Q8VD37 806 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 ArpinQ9D0A3 226 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 FancfE9Q5Z5 343 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Smpd2O70572 419 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam172aQ3TNH5 417 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Epc1Q8C9X6 813 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Sept3Q9Z1S5 350 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pgap3A2A559 320 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r19G5E8G4 854 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Usp35M0QWN7 1009 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ercc5P35689 1170 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Rab6bP61294 208 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Siah1bQ06985 282 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 MyrflQ3UN70 904 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kctd16Q5DTY9 427 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tmem199Q5SYH2 208 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mindy1Q76LS9 468 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Stk40Q7TNL3 435 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 PdhxQ8BKZ9 501 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pcdhb19Q91Y01 801 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lpin2Q99PI5 893 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tmem86aQ9D8N3 241 aa16.97■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Myl4P09541 193 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 AcrP23578 436 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc110Q3V125 848 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Esyt3Q5DTI8 891 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Atpaf2Q91YY4 289 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Serpinb3cA2RSF9 386 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Brcc3P46737 291 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Thumpd3P97770 505 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pdlim7Q3TJD7 457 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Pde1aQ61481 565 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r43Q80Z08 845 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Q8CCC3 530 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cog4Q8R1U1 785 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cul2Q9D4H8 745 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Atp11cQ9QZW0 1129 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zfp990B1AVN5 605 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Zfy1P10925 782 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fgfr1P16092 822 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kcnj2P35561 428 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Prpf39Q8K2Z2 665 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 Stk4Q9JI11 487 aa16.96■□□□□ 0.31
Ttl-201ENSMUST00000035812 FlgP11088 336 aa16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Cd68P31996 326 aa16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Psg29Q3URN6 468 aa16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fam167aQ6P1G6 215 aa16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 HpdlQ8K248 371 aa16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa16.96■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Wfdc16A2A5H4 111 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm2237E9Q501 211 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 4930544D05RikJ3QK56 214 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gm3591K7N6X2 186 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Morf4l1P60762 362 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ppm1jQ149T7 507 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nipal1Q8BMW7 416 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Usp38Q8BW70 1042 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mtss1Q8R1S4 759 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Mgea5Q9EQQ9 916 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Vmn2r77L7N2B7 854 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Lrrc4bP0C192 709 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 InscQ3HNM7 579 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Becn2P0DM65 447 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Gja8P28236 440 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Kif2aP28740 705 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Nr1d1Q3UV55 615 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Fbxo39Q5NBU5 443 aa16.95■□□□□ 0.3
Ttl-201ENSMUST00000035812 Ccdc68Q8BVC4 333 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms