RNA–Protein interactions for RNA: YMR255W

GFD1, Transcript of Coiled-coiled protein of unknown function, yeast

Gene GFD1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GFD1	YMR255W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	RPL39	P04650	51 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	SRP21	P32342	167 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	FPR2	P32472	135 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YBR220C	P38318	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	IRC22	P40006	225 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	DSK2	P48510	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	OCA2	P53949	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YHP1	Q04116	353 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	HMX1	P32339	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YAR068W	P39564	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	SAS2	P40963	338 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	NAT3	Q06504	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	DCN1	Q12395	269 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	COA6	Q3E846	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GFD1	YMR255W	YGL010W	P25338	174 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SCM4	P32564	187 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SRP14	P38985	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YIL163C	P40448	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	OST3	P48439	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	MCH1	Q07376	486 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YKL075C	P36083	450 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	DAD2	P36162	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YCR041W	P37265	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	CPD1	P53314	239 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SED1	Q01589	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SOR2	Q07786	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	GEP5	Q12393	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	MRPL44	P19956	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	DAL80	P26343	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	CSH1	P38287	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	CTR2	P38865	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YNL046W	P53956	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	FUN14	P18411	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YBR090C	P38253	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YHR173C	P38864	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	BDH1	P39714	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YGR018C	P53211	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	ARR2	Q06597	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	QRI5	P32344	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YKR045C	P36138	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	ECM14	P38836	430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	LST8	P41318	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YIP1	P53039	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	MIX17	Q03667	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	FIT2	Q08906	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	TIR1	P10863	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	PAM17	P36147	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YBL071C	P38185	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	DOG2	P38773	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	DOG1	P38774	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	RPB11	P38902	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	ATP19	P81451	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	STD1	Q02794	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	RAV2	Q03956	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	CUP2	P15315	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	MIX23	P38162	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SFT2	P38166	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	AIM24	P47127	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	SUR7	P54003	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	MRX11	Q03079	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFD1	YMR255W	TCA17	P32613	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	IES6	P32617	166 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YKL102C	P34249	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YER121W	P40076	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	HUA1	P40325	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFD1	YMR255W	YNR064C	P53750	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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