RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	NSE4	P43124	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	GPI2	P46961	280 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YDL183C	P48569	320 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YIP3	P53633	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	ATP23	P53722	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	HCH1	P53834	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YMR253C	Q04835	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	POS5	Q06892	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
DRE2	YKR071C	SPC25	P40014	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	GTT1	P40582	234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	LCB3	P47013	409 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	LST7	P53237	242 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	GPI15	P53961	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	COX19	Q3E731	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YCR001W	P25347	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YEA4	P40004	342 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	GLE2	P40066	365 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	GAT4	P40569	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	RPR2	P40571	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	IMP2	P46972	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	SGF11	Q03067	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	ADD37	Q03233	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	SDH7	Q04401	133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DRE2	YKR071C	CSH1	P38287	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YJR015W	P47090	510 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	DAN1	P47178	298 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	PKP2	P53170	491 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	HST4	P53688	370 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	UBC7	Q02159	165 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	TMA23	Q03525	211 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
DRE2	YKR071C	YCR025C	P25352	136 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	SHG1	P38337	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	MIG3	P39943	394 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YER135C	P40082	130 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	VMA21	P41806	77 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	MOG1	P47123	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	TIM21	P53220	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	PDR17	P53844	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	COA2	Q3E823	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YBR013C	P38215	129 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	ATG27	P46989	271 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	FPR2	P32472	135 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YPT10	P38146	199 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	SLM6	P38343	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	BNS1	P50084	137 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	IZH1	Q03419	316 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	VAM10	Q08474	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YOR015W	Q12169	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	AYT1	Q12226	474 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	POF1	P25576	258 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	PHD1	P36093	366 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	RIB5	P38145	238 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YNR066C	P53752	436 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	CTR3	Q06686	241 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	LAC1	P28496	418 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	MRPL4	P36517	319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	SFT2	P38166	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YBR292C	P38357	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	PAU15	P40585	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	AIM24	P47127	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	LOA1	Q06508	300 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	PRR2	Q12310	699 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DRE2	YKR071C	AHT1	P29589	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.1 ms