RNA–Protein interactions for RNA: YHR171W

ATG7, Transcript of Autophagy-related protein and dual specificity member of the E1 family, yeast

Gene ATG7, Length 1,893 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG7	YHR171W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG7	YHR171W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATG7	YHR171W	YPI1	P43587	155 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG7	YHR171W	IRC23	Q08416	157 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATG7	YHR171W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	PIR5	P46999	287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	SCP1	Q08873	200 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	FLX1	P40464	311 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YIR035C	P40579	254 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	FEX1	Q08913	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	FEX2	Q08991	375 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	MIG1	P27705	504 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YET1	P35723	206 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	UBR1	P19812	1950 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	ERV15	P38312	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	NHP10	Q03435	203 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	INO4	P13902	151 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YDL241W	Q07738	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	MED11	Q99278	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	PDR11	P40550	1411 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	UIP4	Q08926	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	HAP3	P13434	144 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
ATG7	YHR171W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YGL260W	P53056	76 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	KEI1	Q06346	221 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	ATG40	Q99325	256 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	REV3	P14284	1504 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
ATG7	YHR171W	MAK31	P23059	88 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YCR099C	P25657	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	ERG25	P53045	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	BOL2	P53082	120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	SCM4	P32564	187 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YFR035C	P43608	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YGR164W	P53291	111 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	ATG41	Q12048	136 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	GTT2	Q12390	233 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YKL044W	P36092	106 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	SNF11	P38956	169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YER084W	P40057	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YFL012W	P43580	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	UPS3	Q04006	179 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	SOM1	Q05676	74 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	IRC19	Q07843	230 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	CLB6	P32943	380 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	PIR1	Q03178	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	COX5B	P00425	151 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	ATP19	P81451	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	QCR10	P37299	77 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YEL067C	P39978	195 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	TIR3	P40552	269 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	KNH1	P50112	268 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	FYV5	P25585	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YHR130C	P38834	111 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	YHP1	Q04116	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG7	YHR171W	PEX4	P29340	183 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YEL045C	P32616	141 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	TDA2	P40045	126 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	GRX5	Q02784	150 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YIL059C	P40520	121 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	MSB2	P32334	1306 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	UTH1	P36135	365 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	ERV14	P53173	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YML079W	Q03629	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	RSF2	P46974	1380 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG7	YHR171W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.5 ms