RNA–Protein interactions for RNA: YHL039W

EFM1, Transcript of Lysine methyltransferase, yeast

Gene EFM1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFM1	YHL039W	YAR068W	P39564	161 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YFL054C	P43549	646 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	MIC27	P50945	234 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	CRZ1	P53968	678 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YML079W	Q03629	201 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	BET5	Q03630	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	MOB1	P40484	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YIL012W	P40551	113 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	RAV2	Q03956	351 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	IMP1	P28627	190 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	FZF1	P32805	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	ELC1	Q03071	99 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	ECM14	P38836	430 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	TRS23	Q03784	219 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YPR098C	Q06089	161 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	AYT1	Q12226	474 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	RPL12B	P0CX54	165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	SFT2	P38166	215 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	DOG2	P38773	246 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	TOM7	P53507	60 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YMR254C	Q04838	102 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	BOL1	Q3E793	110 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	INO4	P13902	151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YHR173C	P38864	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	ATP19	P81451	68 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	IRC25	Q07951	179 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	TIM18	Q08749	192 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	PRM3	Q08931	133 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YOR304C-A	O14468	76 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YJR096W	P47137	282 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YPL080C	Q02826	108 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YMR210W	Q03649	449 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YPS3	Q12303	508 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	ROX3	P25046	220 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	REC104	P33323	182 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YPI1	P43587	155 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	CIS3	P47001	227 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	PIN2	Q12057	282 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	ISD11	Q6Q560	94 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.49
EFM1	YHL039W	YPT10	P38146	199 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	SNF11	P38956	169 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YFR045W	P43617	309 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YNL092W	P53934	400 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	UBC13	P52490	153 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	HNT3	Q08702	217 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	FIT2	Q08906	153 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	ATX1	P38636	73 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YIL029C	P40538	142 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YFL065C	P43539	102 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	EOS1	P53938	366 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YPR203W	Q08994	102 aa		5.7	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YGR045C	P53229	120 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	PCP1	P53259	346 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	HSK3	P69852	69 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		5.69	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YPS1	P32329	569 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	OST2	P46964	130 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	LCL3	P53153	274 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	MIX17	Q03667	156 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YLR296W	Q05898	108 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	RAF1	Q06891	181 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YDL218W	Q07629	317 aa		5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	MDM10	P18409	493 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	APS1	P35181	156 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	PET8	P38921	284 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	MST28	P39552	234 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	REE1	P40893	198 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	SUR7	P54003	302 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	GTO3	Q04806	366 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	VPS63	O13549	108 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	VAR1	P02381	398 aa		5.67	□□□□□ -1.5
EFM1	YHL039W	DUT1	P33317	147 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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