RNA–Protein interactions for RNA: YGR041W

BUD9, Transcript of Protein involved in bud-site selection, yeast

Gene BUD9, Length 1,644 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD9	YGR041W	SRB6	P32570	121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD9	YGR041W	HHO1	P53551	258 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD9	YGR041W	ATG39	Q06159	398 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD9	YGR041W	HRD1	Q08109	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD9	YGR041W	VPS68	Q12016	184 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BUD9	YGR041W	COX10	P21592	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	MRP17	P28778	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SWD3	P38123	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	DLS1	P40366	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	MCP1	Q12106	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	GEP5	Q12393	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	KIN28	P06242	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	TTI2	P47168	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	ATG10	Q07879	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	DGK1	Q12382	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SGA1	P08019	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	CSH1	P38287	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SNN1	P48232	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	CCC1	P47818	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	CPR5	P35176	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YPL073C	P40323	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	MDM35	O60200	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YOR062C	P36025	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YGR026W	P53217	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	AKR2	Q12013	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	APJ1	P53940	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	TSA2	Q04120	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	TIM12	P32830	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	VMA11	P32842	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	GTT1	P40582	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	GLC8	P41818	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	OST2	P46964	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	RSM10	Q03201	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	SDH7	Q04401	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	MCH1	Q07376	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
BUD9	YGR041W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	PGD1	P40356	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YFR054C	P43622	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YNR062C	P53748	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	CCH1	P50077	2039 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ATP15	P21306	62 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YHR125W	P38831	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
BUD9	YGR041W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	CAB4	P53332	305 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	BUD25	P85052	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YDR366C	P87287	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ODC2	Q99297	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YER134C	P40081	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YFL019C	P43576	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YPI1	P43587	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YGL260W	P53056	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	EST3	Q03096	181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	FMT1	P32785	401 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ERV15	P38312	142 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	MOB1	P40484	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	EMC5	P40540	141 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YGR039W	P53225	103 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	CNL1	Q06333	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	SYM1	Q06563	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	TAO3	P40468	2376 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ATP5	P09457	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
BUD9	YGR041W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	NSE4	P43124	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	FIP1	P45976	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	DSK2	P48510	373 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YML122C	Q03207	126 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms