RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W SNU13P39990 126 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
DDI1YER143W YIL163CP40448 117 aa6.98□□□□□ -1.29
DDI1YER143W HIT1P46973 164 aa6.98□□□□□ -1.29
DDI1YER143W MRX11Q03079 207 aa6.98□□□□□ -1.29
DDI1YER143W SRP21P32342 167 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W YHR173CP38864 112 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W YNL194CP40169 301 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W FIP1P45976 327 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W AIM24P47127 394 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W RAV2Q03956 351 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W HOR7Q05827 59 aa6.97□□□□□ -1.29
DDI1YER143W DDI2P0CH63 225 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W DDI3P0CH64 225 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W RPB3P16370 318 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YKL075CP36083 450 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W PHD1P36093 366 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W SRP14P38985 146 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W POR2P40478 281 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W NSE4P43124 402 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W MGA1P53050 456 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W CAB4P53332 305 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YMR181CQ03231 154 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W ATX2Q12067 313 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W DYN1P36022 4092 aa6.96□□□□□ -1.3
DDI1YER143W MRS1P07266 363 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W ERS1P17261 260 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W POF1P25576 258 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W TOS8P53147 276 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W TOM7P53507 60 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YOP1Q12402 180 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W LAS17Q12446 633 aa6.95□□□□□ -1.3
DDI1YER143W FMP49A0A023PZB3 126 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YNK1P36010 153 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YBR013CP38215 129 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YBR090CP38253 122 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W HSP10P38910 106 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W HUA1P40325 198 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W GTT1P40582 234 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W DUG3P53871 357 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W DAD3P69850 94 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W MSA1Q08471 629 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YPR013CQ12145 317 aa6.94□□□□□ -1.3
DDI1YER143W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W TIR2P33890 251 aa6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YIL077CP40508 320 aa6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W HAM1P47119 197 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W MOG1P47123 218 aa6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W NAT3Q06504 195 aa6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W ZEO1Q08245 113 aa6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YLR302CO13544 120 aa6.92□□□□□ -1.3
DDI1YER143W CYC7P00045 113 aa6.92□□□□□ -1.3
DDI1YER143W COX2P00410 251 aa6.92□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YGR026WP53217 278 aa6.92□□□□□ -1.3
DDI1YER143W ATP19P81451 68 aa6.92□□□□□ -1.3
DDI1YER143W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
DDI1YER143W FYV6P53913 173 aa6.91□□□□□ -1.3
DDI1YER143W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
DDI1YER143W TIR1P10863 254 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W MBB1P39534 108 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W PAU5P43575 122 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YPI1P43587 155 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W LCB3P47013 409 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W ATG39Q06159 398 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W YOL160WQ08321 113 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W DCN1Q12395 269 aa6.9□□□□□ -1.3
DDI1YER143W SNF11P38956 169 aa6.89□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YGR025WP53216 100 aa6.89□□□□□ -1.31
DDI1YER143W APS2Q00381 147 aa6.89□□□□□ -1.31
DDI1YER143W UBC7Q02159 165 aa6.89□□□□□ -1.31
DDI1YER143W IZH1Q03419 316 aa6.89□□□□□ -1.31
DDI1YER143W HTB2P02294 131 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W QRI5P32344 111 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W FZF1P32805 299 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PRY2P36110 329 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YPT10P38146 199 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W GET2P40056 285 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YMR141CP40211 102 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W ATP16Q12165 160 aa6.88□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PAU19P0CE85 124 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PAU21P0CE86 164 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PAU22P0CE87 164 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YER190C-BP0CX94 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YEL077W-AP0CX95 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YGR296C-BP0CX96 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YPL283W-BP0CX97 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YPR204C-AP0CX98 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YFL068WP0CX99 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YLL066W-AP0CY00 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YLL067W-AP0CY01 160 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W YGL010WP25338 174 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PAU3P25610 124 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W AME1P38313 324 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W RPA43P46669 326 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W CAX4P53223 239 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PRM3Q08931 133 aa6.87□□□□□ -1.31
DDI1YER143W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
DDI1YER143W PRE9P23638 258 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
DDI1YER143W CMC1P36064 111 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 97.4 ms