RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641383.1

AP003175.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP003175.1, Length 6,658 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003175.1-201ENST00000641383 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 APBB2Q92870 758 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PTPRN2Q92932 1015 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 STK33Q9BYT3 514 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 NLNQ9BYT8 704 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CAPN10Q9HC96 672 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ACSL3O95573 720 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PPM1NQ8N819 430 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SPATA18Q8TC71 538 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 DCLK3Q9C098 648 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ZNF521Q96K83 1311 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 C5orf58C9J3I9 102 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 GJB1P08034 283 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 MCF2P10911 925 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SLCO1A2P46721 670 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 FSTL1Q12841 308 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ARNTL2Q8WYA1 636 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 MAML1Q92585 1016 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 HPS3Q969F9 1004 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 MTSS1O43312 755 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 INHAP05111 366 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 VDRP11473 427 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 BRAFP15056 766 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CHRM3P20309 590 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 TM4SF1P30408 202 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ITGA7Q13683 1181 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 USP41Q3LFD5 358 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 VSTM4Q8IW00 320 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 HES6Q96HZ4 224 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SYT15Q9BQS2 421 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 RAD18Q9NS91 495 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 GAKO14976 1311 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CBX4O00257 560 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CAPZA2P47755 286 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ATP1A2P50993 1020 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 HPCAP84074 193 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 TP53BP2Q13625 1128 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 MTFR1Q15390 333 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SPRYD7Q5W111 196 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CACUL1Q86Y37 369 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 GPT2Q8TD30 523 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CALML6Q8TD86 181 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.55□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 BTBD19C9JJ37 291 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 OPLAHO14841 1288 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 SUPT3HO75486 399 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 FGF19O95750 216 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 F9P00740 461 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PSMC6P62333 389 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 HDAC6Q9UBN7 1215 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 C3P01024 1663 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CCDC78A2IDD5 438 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 THOP1P52888 689 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 CUL2Q13617 745 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ACOX1Q15067 660 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 ZNF677Q86XU0 584 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 C4orf19Q8IY42 314 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 HELQQ8TDG4 1101 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 TTC17Q96AE7 1141 aa7.54□□□□□ -1.2
AP003175.1-201ENST00000641383 MTBPQ96DY7 904 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms