RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF131P52739 623 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 NRLP54845 237 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SPEM2Q0P670 501 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TTI2Q6NXR4 508 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 DRC1Q96MC2 740 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TCHPQ9BT92 498 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ASAH2Q9NR71 780 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ESF4 209 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF263O14978 683 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LRPAP1P30533 357 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ELMOD1Q8N336 334 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SPIRE2Q8WWL2 714 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 REEP2Q9BRK0 252 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP9Q9H5L6 903 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC26A0AVF1 554 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL8P10145 99 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CPB1P15086 417 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX9P48436 509 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC63Q05C16 580 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 MCL1Q07820 350 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC11Q6PKC3 985 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PRU2 124 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1A3P13637 1013 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL12P48061 93 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 STX17P56962 302 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZS52 159 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 CHADO15335 359 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM189A1O60320 539 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINC1P01008 464 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 RETP07949 1114 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 UBASH3AP57075 661 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 ZPBP2Q6X784 338 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 GAREM2Q75VX8 874 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC9BQ8N6N2 239 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR88Q9GZN0 384 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMA1P25391 3075 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PLS3P13797 630 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 FNTBP49356 437 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCY2FP51841 1108 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP4Q13115 394 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 GPIHBP1Q8IV16 184 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PARVGQ9HBI0 331 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNKQ9P0W0 207 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 USP24Q9UPU5 2620 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A8A6NNN8 435 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PPEF2O14830 753 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A4O14863 429 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP3O75074 770 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ADRB1P08588 477 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF9P41273 254 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR17Q13304 367 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R5DQ14738 602 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNN1Q92952 543 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F7Q96AV8 911 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 MSANTD3Q96H12 275 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM209Q96SK2 561 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH11P35749 1972 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM13AO94988 1023 aa25.93■■□□□ 1.74
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