RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANK1P16157 1881 aa17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MUC3AQ02505 3323 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 LCHNA4D1U4 455 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTAGE15A4D2H0 777 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIRO00625 290 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 DYNC1I1O14576 645 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABL1P00519 1130 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTAGE8P0CG41 777 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 BMP1P13497 986 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 DESP17661 470 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRIK3Q13003 919 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 DSC3Q14574 896 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MBTPS1Q14703 1052 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAA35Q5VZE5 725 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 C11orf63Q6NUN7 778 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GLB1LQ6UWU2 654 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC24A5Q71RS6 500 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTAGE6Q86UF2 777 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTAGE4Q8IX94 777 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBL4BQ8N7F7 174 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF169Q8NCN4 708 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBXN4Q92575 508 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SEPT8Q92599 483 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLVAPQ9BX97 442 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 LHX5Q9H2C1 402 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGS18Q9NS28 235 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAM22Q9P0K1 906 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 EFCAB8A8MWE9 144 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CES2O00748 559 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 HOXA2O43364 376 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 LPXNO60711 386 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTA2O94776 668 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYP1A2P05177 515 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 UNGP13051 313 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MLH1P40692 756 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC8A3P57103 927 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNGA2Q16280 664 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERICH1Q86X53 443 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCOLN2Q8IZK6 566 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOP6BLQ8N6T0 577 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR6B3Q8NGW1 331 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CXorf38Q8TB03 319 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA1Q92805 767 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELMO3Q96BJ8 720 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PBKQ96KB5 322 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDHB18PQ96TA0 734 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF39Q9H2S5 420 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYNCQ9H7C4 482 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 PARVAQ9NVD7 372 aa17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARL5CA6NH57 179 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ENC1O14682 589 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GUCY2FP51841 1108 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOMO3P69849 1222 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP221Q4G0U5 840 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEI1Q5TIA1 1274 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 METTL23Q86XA0 190 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ECHDC2Q86YB7 292 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABI1Q8IZP0 508 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM86AQ8N2M4 240 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA18Q8TC71 538 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GAD1Q99259 594 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP85Q9BW27 656 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CARD6Q9BX69 1037 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAS2R14Q9NYV8 317 aa17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 A8MXQ7 604 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GJB5O95377 273 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SETSIPP0DME0 302 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC1A1P43005 524 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAP1GAPP47736 663 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 KCNQ1P51787 676 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 NDST1P52848 882 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 RAD23BP54727 409 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 DSTYKQ6XUX3 929 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBED2Q9BTP6 218 aa17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 DSEQ9UL01 958 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms