RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592354.5

CAPNS1-213, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAPNS1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-213ENST00000592354 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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CAPNS1-213ENST00000592354 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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CAPNS1-213ENST00000592354 NLRP12P59046 1061 aa14.5□□□□□ -0.09
CAPNS1-213ENST00000592354 MYL7Q01449 175 aa14.5□□□□□ -0.09
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CAPNS1-213ENST00000592354 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.48□□□□□ -0.09
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CAPNS1-213ENST00000592354 CSH2P0DML3 217 aa14.47□□□□□ -0.09
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CAPNS1-213ENST00000592354 CXCL12P48061 93 aa14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-213ENST00000592354 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-213ENST00000592354 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-213ENST00000592354 PLCB2Q00722 1185 aa14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-213ENST00000592354 MYO1EQ12965 1108 aa14.47□□□□□ -0.09
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